以下是区分诊断，分为主要诊断和次要诊断 闭经。
原发性闭经
先天性畸形，畸形和染色体异常（Q00-Q99）。
- Laurence-Moon-Biedl-Bardet综合征（LMBBS）–具有常染色体隐性遗传的罕见遗传疾病； 通过临床症状分为：
- 劳伦斯-月亮综合症（无多指，即没有出现多余的手指或脚趾和肥胖症，但患有截瘫（截瘫）和肌张力低下/肌张力降低）和
- Bardet-Biedl综合征（多发性， 肥胖 和肾脏的特殊性）。
- Mayer-von-Rokitansky-Küster-Hauser综合征（MRKH综合征或Küster-Hauser综合征）–具有常染色体显性遗传的遗传性疾病； 女性生殖器的先天性畸形是由于胚胎第二个月的米勒导管畸形所致。 卵巢功能（雌激素和孕激素的合成）没有受到损害，可以使第二性征正常发育。
- 卵巢发育不全–发育不全 卵巢 由于各种疾病，例如 特纳综合征 （性腺发育不全）。
内分泌，营养和代谢性疾病（E00-E90）。
- 肾上腺生殖器综合征 （AGS）–常染色体隐性遗传性代谢疾病，其特征为肾上腺皮质激素合成异常。 这些疾病 铅 缺乏 醛固酮 和 皮质醇; 全世界的平均发病率（新病例的发生率）为1：14,500； 性分化障碍（DAD）中最常见的临床表现； 雌性核型（46，XX），伴有外生殖器的男性化（男性化）（由于产前雄激素过多）。
- Kallmann综合征（同义词：泌乳生殖器综合征）–可以偶发发生的遗传性疾病，以及遗传的常染色体显性遗传，常染色体隐性遗传和X连锁隐性遗传； 体质低下或厌食的症状复合体（减少至缺乏感觉） 气味）并伴有睾丸或卵巢发育不全（睾丸发育不良或 卵巢， 分别）; 男性1：10,000和女性1：50,000的患病率（疾病频率）。
泌尿生殖系统（肾脏，泌尿道–生殖器官）（N00-N99）。
- 处女膜闭锁 处女膜).
- 阴道发育不良-胚胎不产生阴道。
继发性闭经
先天性畸形，畸形和染色体异常（Q00-Q99）。
内分泌，营养和代谢性疾病（E00-E90）。
- 肥胖（超重）
- 肢端肥大症 –过度分泌 生长激素 随着肢体末端肢体或acra尺寸的增加。
- 1型糖尿病
- 桥本氏甲状腺炎 –导致慢性甲状腺炎的自身免疫性疾病。
- 血色沉着症 (铁 贮积病）–具有常染色体隐性遗传的遗传病，由于铁增加，铁沉积增加 浓度 ，在 血液 与组织损伤。
- 高雄激素血症（男性增多） 激素 ，在 血液).
- 高泌乳素血症（增加 催乳素 的水平 血液).
- 甲状腺功能亢进症（甲状腺功能亢进症）
- 甲状腺功能减退症
- 艾迪生病 （原发性肾上腺皮质功能不全）。
- 库欣病 –那些疾病 铅 皮质醇过多症（hypercortisolism）–供过于求 皮质醇.
- 多囊卵巢综合征 （PCO综合征）–卵巢中的囊肿形成，导致荷尔蒙功能受损[约25％的继发性女性 闭经].
- 丸后 闭经 –没有 经期 停止使用后 避孕药 （避孕药）。
- Sheehan综合征–后天性垂体前叶功能不全（HVL功能不全）/激素的前叶产生的激素不足 垂体 （=“继发性空蝶鞍综合征（SES））。
- 卵巢早衰–卵巢功能衰竭，进行性滤泡闭锁（无滤泡形成）。
肝，胆囊和胆道胰腺（胰腺）（K70-K77； K80-K87）。
肿瘤– 肿瘤疾病 （C00-D48）。
- 胃母细胞瘤–非常罕见，通常是卵巢的单侧（单侧）肿瘤 雄激素 从而导致 雄激素化 症状（多毛症/男性 分配 终端模式 头发，皮脂溢/过量生产 皮肤 阴蒂的油 肥大/异常大的阴蒂，声音改变； 高雄激素 卵巢功能不全).
- 垂体瘤 垂体).
- 卵巢肿瘤（卵巢肿瘤），无更多细节。
- 泌乳素瘤–前部良性肿瘤 垂体 （垂体）。
灵魂– 神经系统 （F00-F99; G00-G99）。
- 神经性厌食症
- 神经性贪食症（暴食症）
- 下丘脑区域发炎
- 垂体瘤（垂体的肿瘤）。
- 下丘脑 肿瘤（间脑肿瘤）。
症状和异常的临床及实验室发现未在其他地方分类（R00-R99）。
- 体重减轻异常（> 10％）。
泌尿生殖系统（肾脏，泌尿道–生殖器官）（N00-N99）。
药物治疗
进一步
