以下是西尼罗河热可能导致的最重要的疾病或并发症：
眼睛和眼附件（H00-H59）。
- 视神经炎 （视神经炎）。
心血管系统（I00-I99）
肝，胆囊和 胆汁 胰管（K70-K77; K80-K87）。
肌肉骨骼系统和 结缔组织 （M00-M99）。
- 麻痹（麻痹迹象）。
心理–神经系统（F00-F99; G00-G99）
- 脑炎（大脑发炎）–通常会导致后遗症（占病例的50％）； 与70岁以上人群的致死率（相对于患有该疾病的总人数相对的死亡率）增加有关（15-40％）
- 脑膜炎 （脑膜炎）。
- 多发性神经根炎（多神经根发炎）。
症状和异常的临床及实验室发现未在其他地方分类（R00-R99）。
- 共济失调（步态障碍）
