以下是衣原体感染可能导致的最重要的疾病或并发症：
呼吸系统（J00-J99）
眼睛和眼附件（H00-H59）。
- 阿玛特病（失明）
- 角膜的乳浊化
- 角膜疤痕
心血管系统（I00-I99）
传染病和寄生虫病（A00-B99）。
- 衣原体感染的复发（复发）。
肝，胆囊和胆道胰腺（胰腺）（K70-77； K80-K87）。
口，食道（食道）， 胃和小肠（K00-K67; K90-K93）。
- 直肠炎（直肠炎症）。
肌肉骨骼系统和 结缔组织 （M00-M99）。
- 无功 关节炎 （同义词：感染后关节炎/关节发炎）–胃肠道（影响胃肠道），泌尿生殖器（影响泌尿和生殖器官）或肺部（影响肺）感染后的继发疾病； 指在关节（无菌）中（通常）未发现病原体的关节炎 滑膜炎).
- 瑞特氏病（同义词： 瑞特氏综合症; 瑞特氏病； 关节炎 痢疾 关节炎 肠; 肠胃后关节炎； 姿势性关节炎未分化的寡关节炎； 尿道眼动系统综合征； Fiessinger-Leroy综合征； 英语获得性 反应性关节炎 （SARA））–“反应性关节炎”的特殊形式（见上文。）； 胃肠道或泌尿生殖道感染后的继发性疾病，其特征是雷特氏三联征； 血清阴性的脊柱关节炎，尤其是在 HLA-B27 肠道或泌尿道疾病阳性的人 菌 （大多 衣原体）; 可以表现为 关节炎 （关节发炎）， 结膜炎 （结膜炎）， 尿道炎 （尿道炎），部分与典型 皮肤变化.
肿瘤– 肿瘤疾病 （C00-D48）。
灵魂– 神经系统 （F00-F99; G00-G99）。
- 感染 脑，尤其是在新生儿中。
- 流产（流产）
- 宫外孕 –外孕 子宫; 子宫外 怀孕 大约有1至2％的孕妇出现：输卵管重力（输卵管妊娠），卵巢重力（卵巢妊娠），腹膜重力或腹部重力（腹部妊娠），宫颈重力（妊娠）。 宫颈).
- 早产 （在第37周完成之前的婴儿出生 怀孕 （SSW））。
泌尿生殖系统（肾脏，泌尿道–性器官）（N00-N99）。
