以下是桥本甲状腺炎可能导致的最重要的疾病或并发症：
呼吸系统（J00-J99）
内分泌，营养和代谢性疾病（E00-E90）。
- 甲状腺功能减退症（甲状腺功能减退；明显或潜在）； 从潜伏性甲状腺功能减退症到确定性甲状腺功能减退症的进展速度
- 粘液性水肿 - 糊状（浮肿；肿胀）的皮肤表现出不可推动的、非位置性的面团状水肿（肿胀）； 面部和周边; 主要发生在小腿上
皮肤 和皮下（L00-L99）。
- 脱发（弥漫性脱发）
心血管系统（I00-I99）
肿瘤–肿瘤疾病（C00-D48）
- 甲状腺癌
耳朵–乳突过程（H60-H95）
- 听力损失
心理–神经系统（F00-F99; G00-G99）
症状和异常的临床及实验室参数，未在其他地方分类（R00-R99）。
- 肌肉痉挛
- 肌肉疼痛
- 肌肉僵硬
泌尿生殖系统（肾脏，泌尿道–性器官）（N00-N99）
