PCR 检测:安全性、程序、意义

什么是 PCR 测试?

PCR 测试是分子生物学和医学中使用的一种实验室方法。 该测试用于直接检测和表征遗传物质。 专家认为PCR方法易于操作、普遍适用且稳健。

在实验室中,PCR 测试由两个步骤组成。 第一步,使用聚合酶链式反应 (PCR) 扩增现有遗传物质。 这样可以检查最小的 DNA 痕迹。 这也是PCR检测反应如此敏感的原因。

第二步,根据遗传物质的特性进行分离、“分类”并由此表征。 换句话说,DNA的精细结构是确定的。

有许多可能的应用:例如,医生使用 PCR 检测来检查拭子中是否存在冠状病毒、为艾滋病毒献血或筛查新生儿是否可能存在遗传性疾病。 细菌感染(例如结核病原菌感染)或寄生虫感染(疟疾)也可以使用 PCR 进行澄清。

它们还可以根据基因指纹在法医学中帮助对犯罪者定罪,或者用作亲子鉴定。

PCR检测的有效期是多长?

PCR 检测结果通常在取样后 48 小时内有效。

PCR 检测的可靠性如何?

PCR 是分子诊断和医学中久经考验的检测方法。 它被视为错误率极低的所谓黄金标准。 这些测试的特点是非常高的敏感性和特异性。

灵敏度是指测试发现待检测遗传物质的可靠性。

特异性是指测试确定样本中不存在相关遗传物质的确定性。

PCR 检测何时适用于 Sars-CoV-2 感染?

一般来说,PCR 检测可在症状出现前 20 至 XNUMX 天和症状出现后 XNUMX 天检测到新冠感染。 即使对于完全没有症状的感染者,该测试在他们可以感染他人的关键时间窗口内也是有效的。

在个别情况下,甚至可以在症状出现 60 天后检测到。

可能的错误来源

DNA复制过程中的错误率在实践中可以忽略不计。 尽管 DNA 聚合酶从来都不是没有错误的,但它们在 PCR 测试过程中几乎没有发挥作用。

在实践中,潜在的错误来源更多地存在于样本采集中:因此,由经过培训的医疗专业人员进行拭子检测非常重要。 唾液和漱口水样本可能会降低测试的准确性,因为此处会发生稀释效应。

PCR 检测如何进行?

PCR 检测例如由家庭医生或在特殊检测中心进行。 首先,医生或经过培训的医疗专业人员采集样本。 通常从上呼吸道采集拭子进行测试。 这通常采用口腔或鼻咽拭子的形式。

也可以用冲洗液漱口。 血液样本对于电晕检测来说是非典型的,但广泛用于新生儿筛查等。

无论采集的样本类型如何,在棉签、冲洗液或血滴中都会发现遗传物质。 该样品材料被送往实验室,在那里进行分离和纯化。

PCR 测试分为两个步骤:

  • PCR:在此步骤中,初始遗传物质的数量被扩增。

第 1 步:PCR——“聚合酶链式反应”

“PCR”是两个步骤中的第一步:这是扩增可用起始 DNA 量的地方。 这是因为遗传物质只有在数量充足的情况下才能进行分析。 在大多数情况下,这是人类 DNA; 就冠状病毒检测而言,它是病毒 RNA。

PCR 缩写代表“聚合酶链式反应”。

PCR 需要什么?

将起始 DNA 放入装有特殊物质的反应容器中。 现有的遗传物质作为模板,在某些酶(Taq 聚合酶)和某些基本 DNA 构建块存在的情况下进行复制。

复制过程发生在多次重复运行(循环)中。

具体来说,将以下物质添加在一起:

  • 起始 DNA:要复制的样本材料。
  • 基本 DNA 构建模块:这些是核碱基腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤。
  • DNA 聚合酶:一种将各个 DNA 构建块连接起来形成明确的 DNA 链的酶。 新获得的链是原始起始材料的镜像(互补)。
  • 引物:由 16 至 24 个碱基对组成,充当起始位置和起始信号。 引物显示 DNA 聚合酶复制过程开始的位置(起始 DNA)。

PCR检测是如何进行的?

现在 PCR 所需的所有物质都已存在于反应容器中,遗传物质的实际复制过程就可以开始了。 这仅由温度来启动、控制和停止。

因此,反应容器被依次加热或冷却至不同的温度。 这是通过一种称为热循环仪的特殊设备来完成的。 整个反应大约需要一到两个小时。

PCR 循环的各个步骤是

  • DNA 双链变性:将样品加热至 90 摄氏度左右。 这将原始 DNA 双链分成两条单独的(互补的)单链。
  • 底漆的附着:温度降至略低于60摄氏度。 这会导致引物(正向引物、反向引物)附着到相应单个 DNA 链上的指定位置。

完成一个循环后,温度再次升高到 90 摄氏度左右——循环从头开始。

PCR 方法可用于扩增最多约 3,000 个千碱基对 (kbp) 的 DNA 序列。 这相当于大约 30,000 个基本 DNA 构建块连接在一起形成一条“链”。 作为比较:人类基因组以大约 XNUMX 亿个碱基对存储细胞运行的蓝图和信息,而冠状病毒基因组则由 XNUMX 个碱基对组成。 因此,PCR 测试只能扩增和检查总 DNA 的一小部分。

底漆至关重要

引物的选择对于 PCR 程序至关重要。 例如,在 Sars-CoV-2 诊断中,使用了多种引物(多重 PCR)。

因此,Corona PCR 测试可搜索三种不同的病毒基因:这将整体特异性提高到近 99.99%。 这意味着,在如此高的命中率下,每 10,000 次测试中只有一次假阳性测试(如果样本采集正确)。

现在有多少复制的遗传物质可用?

让我们假设第一个循环后出现两条相同的 DNA 双链。

每个周期后,(复制的)遗传物质的数量加倍。 因此,DNA 的数量呈指数增长。

医生通常会重复这个过程大约二十到三十次。

形象地说,这意味着即使一开始样本中只发现一条DNA双链,经过二十个循环后,反应容器中已经有一百万个相同的拷贝。

Ct值是什么意思?

PCR 运行的循环数以所谓的 Ct 值的形式表示。 “Ct”源自英文术语“cycle Threshold”。 该 Ct 值使得可以对正在寻找的遗传物质的数量做出陈述。

Ct 值低至 20,起始遗传物质较多。 然而,如果 Ct 值较高(大约 30 个循环),则 DNA 相应较少。 因此,PCR 循环必须更频繁地运行。

第 2 步:电泳“按大小排序”

一旦获得足够的“富集”遗传物质,就可以进行电泳。 在此过程中,科学家们利用了 DNA 的一个特殊特性:它的电荷。

各个 DNA 构建块通过带(负)电荷的糖磷酸骨架相互连接。 特定的 DNA 序列越长,其电荷就越高。

这使得遗传物质能够被检查和表征。 在实践中,通常将未知样本与已知参考样本绘制在“起跑线”上,并在一段时间后进行比较。

如果两个序列的“迁移速度”相同,则意味着检测很可能是阳性:检测很可能是阳性 - 您正在寻找的基因包含在样本中。

冠状病毒的特例:样品制备和 RT-PCR

冠状病毒的检测是一个特例。 Sars-CoV-2 是所谓的 RNA 病毒之一。 这意味着 Sars-CoV-2 遗传物质以 RNA(核糖核酸)的形式存在。

RNA 仅在几个方面与 DNA 不同。 除此之外,它以单链形式存在,并且基于糖核糖而不是 2'-脱氧核糖。 核碱基胸腺嘧啶也被尿嘧啶取代作为第四个碱基。

在进行常规 PCR 测试之前,这种病毒 RNA 必须“转录”成 DNA。 这个过程称为逆转录 (RT),因此称为 RT-PCR。 在此过程中获得单链 cDNA(“互补 DNA”)。 在进一步的步骤中,cDNA 单链由第二条镜像 DNA 链补充。

需要多长时间才能得到结果?

样本发送到实验室后,您通常会在一两个工作日内收到结果。 在测试中心,通常直接在现场检查样品,也可能只需要几个小时。 时间跨度很大程度上取决于各自的考试中心及其物流。

尽管工作流程复杂,现代实验室仍能够进行高通量的 PCR 检测。 特殊的自动化设备有助于进行测试。

尽管如此,PCR检测被认为是一种相对“慢”但更可靠的检测方法。

如果结果呈阳性会怎样?

如果样本采集正确,PCR检测呈阳性意味着受检测者感染Sars-CoV-2的可能性非常高。

如果通过 PCR 检测确认您感染了冠状病毒,公共卫生部门将收到相关实验室的阳性检测结果通知。 在这种情况下,公共卫生部门将下令隔离或检疫。

如果我的 PCR 检测呈阳性,我是否会自动具有传染性?

通常是的。 但不总是。 PCR 检测结果应始终结合上下文进行解释。 检测呈阳性首先意味着您携带病毒物质。

补充抗体测试有时是有用的

在这种情况下,抗体测试可以确定 PCR 测试的有效性。 最好与您的医生讨论这个问题。 他们可以帮助您正确解读 PCR 检测结果。

如果结果为阴性怎么办?

PCR 检测结果呈阴性很可能意味着您在采集样本时没有感染 Covid-19,因此目前不具有传染性。 但是,您可能处于早期感染阶段。

电晕感染通常只能在感染后第二天或第三天才能检测到。 因此,结果并不是免费通行证。 因此,您应该继续遵守社交距离和卫生规则,并继续佩戴 FFP2 口罩——以保护您自己和他人。

儿童PCR检测

儿童 PCR 检测与成人 PCR 检测没有什么不同。 样本收集和结果解释都适用于儿童和成人。

PCR 检测有哪些风险?

PCR 测试不涉及任何身体风险。 有些人认为仅通过鼻咽拭子采集样本是令人不安或不愉快的。

PCR 检测的费用是多少?

请注意:如果您在家进行自我检测并收到阳性结果,您应立即通过电话与您的全科医生预约。 您的医生将通过电话与您讨论后续步骤。

或者,最好拨打 116 117 注册 PCR 检测。 理想情况下,您应该待在家里直到进行确认测试,以保护自己和他人。